Dr. Yakob Tomatala lahir di pulau Seram, Maluku dan tamat dari SMA Xaverius, Ambon pada tahun 1967 serta melanjutkan ke Akademi Administrasi Niaga Negara tahun 1968 di kota yang sama. Tahun 1975 beliau menyelesaikan pendidikan teologi (S-1) dari STT Jaffray, Makassar (Ijazah Negara KOPERTIS VII); dan belajar pada STT Injili Indonesia di Yogyakarta tahun 1979.
Beliau kemudian meneruskan studi Pascasarjana pada Asian Theological Seminary (Master of Divinity – M.Div, 1982/83) dan Alliance Biblical Seminary (Master of Intercultural Studies – M.I.S, 1983, tamat dengan Academic Honor), di Quezon City, Manila – Filipina.
Setelah itu, beliau melanjutkan ke Fuller Theological Seminary, School of World Mission, Pasadena, California U.S.A (Master of Arts – M.A in Missiology, dan Doctor of Missiology – D.Miss in Leadership Development, tahun 1990). Dr. Tomatala juga mengikuti Post Doctoral Studies di Institute of Islamic Studies, Asia Pacific Theological Seminary, Baguio City, Filipina, pada tahun 1998.
Dr. Tomatala mengawali pelayanannya sebagai Guru pada SPGA Kristen YPPGI di Nabire, Papua (1974)., Pengajar dan Direktur Sekolah Alkitab dan Kejuruan di Kupang (1976-1980); Dosen dan Pembantu Ketua I STT Jaffray Makassar (1983-1986), Pendiri dan Dekan STT Jaffray Cabang Jakarta (1984-1988, sekarang IFTK Jaffray Jakarta), Rektor IFTK Jaffray Jakarta (1991-2001; 2006).
Beliau pun turut mengajar Program Pasasarjana S-2 dan S-3 di STT Jaffray Makassar, STT Simpson, Ungaran; STT RII Jakarta; STT I3 Batu, Malang; STT AA Jakarta; STT Ebenezer, Tanjung Enim; STA Nusantara Malang; ITKI Jakarta; STT Kharisma Jakarta/ dan Bandung – IMI Australia; ICDS Jakarta; STT Inti, Bandung; STAS, Surabaya; STT Bethani, Surabaya; dan CCS-KPPK Bandung.
Pada tahun awal 2006 beliau memberikan kuliah di Onuri School of Mission, Seoul Korea Selatan; Alliance Bible School di Darchan, Mongolia dan menjadi pembicara utama di Houton College, U.S.A.
Dr. Tomatala juga mengabdi sebagai Anggota BP Yayasan LAI (1991-1996; 1996-2001); Ketua Sinode Gereja Kemah Injil Indonesia (2001-2006); Ketua Yayasan World Relief Indonesia (2005 – 2010); Penesehat BPP GKII (2006-2011); Penasehat PGLII; Penasehat Yayasan EE Indonesia; Pendiri dan Direktur YT Leadership Foundation, Media Penerbit Kristen; YT Graduate School of Leadership (Program Riset) dan Direktur Program Pascasarjana S-3 IFTK Jaffray Jakarta.
Peran Dr. Tomatala sekarang ialah membimbing mahasiswa/i Pascasarjana dengan memberikan kuliah dan penelitian, serta menulis buku, memberikan ceramah atau lokakarya dan menjadi Motivator dalam bidang kepemimpinan, serta terlibat dalam pelayanan relief melalui World Relief Indonesia.